当前相当多的肥料使用者，包括很多经销商，对氯基复合肥存在误解。由于人们无法知道肥料中氯离子的含量究竟有多少。所以，在蔬菜、果树等作物上面，一律谈“氯”色变，片面选择、推荐硫基复合肥，造成种植成本增加。
有些植物对氯离子非常敏感，当吸收量达到一定程度，会明显地影响产量和品质，通常称这些植物为忌氯作物。氯离子较多时，不利于糖转化为淀粉，块根和块茎的淀粉含量会降低；氯离子能促进碳水化合物的水解降低含糖量；氯离子多，会影响烟草的燃烧性，卷烟易熄火；氯离子多时，常对敏感作物幼苗造成危害。氯对茄科作物会产生不利影响。有些作物使用含氯肥料，只是影响口感并不影响产量，并非所有蔬菜和果树都不可使用含氯复合肥。
耐氯能力强的作物土壤氯浓度大于600毫克/1公斤条件下能正常生长的作物。如：水稻、棉花、红麻、菠菜、甜菜、高粱、谷子等。
耐氯能力中等的作物土壤氯浓度大于300～600毫克/公斤条件下能正常生长的作物。如：小麦、油菜、玉米、大豆、蚕豆、豌豆、甘蔗、花生、番茄、黄瓜、萝卜等。
耐氯能力弱的作物只能适应土壤氯浓度小于300毫克/公斤条件下能正常生长的作物。如：马铃薯、西瓜、柑橘、茶叶、辣椒、笕菜、葡萄等在土壤含氯小于50毫克/公斤的地区，这类作物可以适量使用氯化钾，含氯的低氯肥料。莴笋、白菜、甘薯、烤烟、草莓、苹果、幼树为忌氯作物，最好不用氯化铵等含氯化肥。
实践证明，除了烟草，某些特殊作物以外，低氯复混肥完全可以适应大多数果树、蔬菜要求。使用低氯复混肥，可以有效降低投入成本，而不会对品质造成明显影响，而且提高产量。
