造成柱压升高的原因很多。一般是由于柱床内产生了异常的占位性物体，造成流体阻力加大所引起的。
1、流动相过滤不良
因机械性杂质堵塞进口滤片，导致压力升高。这往往是由于流动相没有过滤，或虽已过滤但滤膜孔径过大或滤片损坏，使固体杂质滞留于滤板上所造成的。湿度传感器探头,不锈钢电热管PT100传感器,铸铝加热器,加热圈流体电磁阀
2、霉菌生长
霉菌在流动相中、管路中或柱子进口处繁殖、生长堵塞滤板，导致压力升高。这种现象在夏季，尤其是使用磷酸盐缓冲液为流动相时更易发生。在夏季使用磷酸盐缓冲液时一般要现配现用。即使保存在冰箱中，一般也不要超过两天。否则，即使不堵塞滤板，也会因细菌或霉菌孳生产生代谢物而造成对样品分析的干扰。
3、非特异性吸附
当溶质在柱子上有较强的非特异性吸附，且当前所用的流动相难以将它们洗脱时，累积的未洗脱溶质也会造成阻力增大和压力升高。
4、更换流动相时置换不彻底
当改换流动相体系时，不彻底的更换使不同性质、互不混溶的流动相存在于一个体系之中，也会造成压力升高。
5、盐晶体的析出
使用缓冲液或添加有缓冲液的流动相后，缓冲液中的无机盐成份可能会残留在体系之中。它们会因在新流动相体系中的溶解度降低而析出，造成流体阻力加大、压力升高。
6、样品的沉淀
当样品所使用的溶剂与流动相不一致时，样品进入柱中有时可能因溶解度降低而沉淀出来，造成压力升高。
7、压力脉冲
运行过程中，有时会产生系统内压力的突然升降。例如，转动进样阀时动作过缓，造成液流堵塞后再瞬间释放;开机瞬间压差较高等。如此所形成的压力脉冲会造成多孔填料的崩坏和柱床结构的微小变化。填料微屑的长期积累也可能会使柱床阻力增大。
