电压互感器在运行中一定要保证二次侧不能短路，因为其在运行时是一个内阻极小的电压源，正常运行时负载阻抗很大，相当于开路状态，二次侧仅有很小的负载电流。若二次侧短路时，负载阻抗为零，将产生很大的短路电流，巨大的发热会将互感器烧坏，甚至导致发生设备爆炸事故。
在运行中为了达到对电压互感器的良好保护，可以采取以下措施：
(1) 二次侧熔断器是保证电压互感器安全运行的可靠措施，必须选择适当的熔断器，并加装闭锁装置。
(2) 为避免开口三角绕组两端在电压不平衡的情况下，长时间存在较高电压。在开口三角绕组两端加装并联电阻，并联电阻在开口三角感应出零序电压时，使零序电流得以流通，对高压线圈产生去磁作用，从而也能抑制谐振。
(3) 在绝缘监察装置回路中，为了使绝缘监察继电器和电压表能正确反映电网的接地故障，还必须注意与电压互感器以及结构等有关的问题。即为了反映每相对地电压，电压互感器高压侧的每相绕组必须接在相与地之间，高压绕组必须呈星形接地，而且还要有中性点接地，同时，电压互感器的低压侧两绕组也必须有一点接地。
(4) 在10 kV以下配电网络中，电源侧的中性点是不直接接地的，电压互感器的中性点接地。因此由于系统操作，开关合闸不同期及单相接地等原因，常常出现过电压，引起电压互感器高压熔丝熔断、冒烟甚至烧毁。因此必须选用伏安特性比较好的电压互感器或在中性点加装阻尼电阻。
(5) 对于电容式电压互感器，有一个末屏点，也就是一次线圈的非极性端。在运行中末屏可以采取两种方式：一种是末屏直接接地，这样在雷击或者振荡等情况下，一次侧若出现过电压可以有效防止烧毁;如果末屏不直接接地，那么必须在末屏和地之间设击穿间隙，这样在出现过电压时能够通过间隙放电而释放。
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