底肥是施肥中最重要的一个环节，对作物生长发育至关重要，施用底肥一般要从底肥的种类、数量、肥料品种及施用的深度四个方面考虑。
从种类上看，有机肥（包括农家肥、厩肥、绿肥和饼肥）最适宜作底肥施用，此外氮、磷、钾和微肥也皆适合作底肥。
要确定底肥施用数量尤其是化肥施用量，必须考虑土壤肥力高低，在有机质低于1.2％的土壤应施用3立方米／亩以上的有机肥。当土壤中速效氮、磷、钾及微量元素低于作物施肥有效临界值时，就应首先选择底施这些肥料，尤其是作物在前期需要较多的磷肥。
各种肥料作底肥的具体用量可参照当地多年田间肥效试验结果及目标产量等综合因素确定，一般高肥力土壤上氮肥总用量的30％左右底施，中、低肥力土壤则有50％～70％的氮肥作为底肥，而磷、钾肥及微肥尽可能一次全部底施。
从肥料品种上看，氮肥中的碳铵，磷肥中的普钙、二铵、钙镁磷肥、三料，钾肥中氯化钾、硫酸钾、草木灰，微肥中的锌肥、锰肥等，都适宜作底肥。
从深度方面讲，一般底肥应施到整个耕层之内，即15～20厘米的深度。对于有机肥、氮肥、钾肥、微肥，可以混合后均匀地撒在地表，随即耕翻入土，做到肥料与全耕层土壤均匀混合，以利于作物不同根系层对养分的吸收利用。
磷肥由于移动性差，且施入土壤后易被固定而失去有效性，故在底施时应分上下两层施用，即下层施至15～20厘米的深度，上层施至5厘米左右的深度。上层主要满足作物苗期对磷的需求，下层供应作物生长中、后期的磷素营养。
