一般认为，根除Hp不能逆转胃黏膜肠化生，但能部分逆转胃黏膜萎缩，延缓或停止萎缩的发展，由此可预防、降低胃癌发病率。Mabe等随访了日本北海道4133例感染Hp的患者，发现早期根除Hp的患者胃癌发生率远低于Hp未根除的患者。该结论在国内、台湾的大型研究中也得到证实。
但2018年韩国研究显示，根除Hp能逆转胃黏膜肠化生。该研究随访了598名Hp感染患者，随访时间长达10年，分别于1年、2年、3~4年和≥5年进行胃镜及活检病理检查，结果：
①Hp根除组胃窦和胃体黏膜的萎缩显著改善。Hp根除组和Hp阴性对照组之间，萎缩性胃炎的显著差异在1年的随访中消失。
②Hp根除组胃窦和胃体黏膜的肠化生显著改善。Hp根除组和Hp阴性组之间，胃窦和胃体黏膜的肠化生分别在随访5年后、随访3年后，其显著性差异消失。
逆转胃黏膜肠化生需要较长时间，起码3～5年，过去认为根除Hp不能逆转肠化生可能由于随访时间欠长有关。
因此，Hp阳性的胃黏膜肠化生患者，首先必须根除Hp，否则有可能使肠化生进一步加重，甚至癌变。
2、抗胆汁反流
胆汁酸被认为是胃黏膜肠化生的主要发病因素之一，因此，对胆汁反流性胃炎患者来讲，预防和治疗胆汁反流及其引起的胃炎就相当重要了。
①抑制胃酸
质子泵抑制剂（奥美拉唑、潘托拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑等）、H2受体阻止剂（雷尼替丁、法莫替丁等）可小剂量短时间使用，有助于胃黏膜炎症和糜烂的修复，切忌长时间大剂量使用反而会加重胃萎缩和肠化生。
②促胃动力药
如莫沙比利、伊托比利、多潘立酮，可促进胃的蠕动，防止胃逆蠕动，减少胆汁反流。
③胃黏膜保护剂
铝碳酸镁，可络合胆酸，保护修复胃黏膜，并中和胃酸，有利于胃黏膜的修复，尤其适合治疗胆汁反流性胃炎。
瑞巴派特，可保护修复胃黏膜，拮抗氧自由剂（是引起胃损伤和炎症的重要原因），减轻胃黏膜炎症，也适合于胆汁反流性胃炎的治疗。
其它胃黏膜保护剂，如硫糖铝、麦滋林、尿囊素铝等，可隔离胆汁或和促进胃黏膜修复等。
④熊去氧胆酸
熊去氧胆酸能与胃黏膜中的黏蛋白络合形成一层保护膜，促进胃黏膜上皮细胞的移行和修复，有效减轻胆汁、胃酸对胃黏膜的刺激；并可以减少胆汁中的胆汁酸的比例，以此减少对胃黏膜的损伤。
3、抗氧化剂
叶酸、维生素B族等抗氧化剂，可能参与维护DNA甲基化状态，抑制癌基因表达，可逆转胃黏膜萎缩、肠化生、异型增生。故叶酸、维生素B族等抗氧化剂可用于胃黏膜肠化生的治疗，已被多项研究证实有效。
但注意使用叶酸之前，必须排除胃癌，否则反而可能加重胃癌进展。
4、内镜下治疗
为了预防胃癌发生，对胃黏膜肠化生患者胃镜定期随访很重要，一般认为：
轻度肠化生，2年做一次胃镜；
中、重度肠化生者应每年做一次胃镜；
做胃镜时必须活检病理检查，以明确萎缩、肠化生的情况，有无异增生（异增生是更重要的胃癌前病变）及早期胃癌。
一旦发现早期胃癌或中重度异型增生，需要胃镜下治疗。目前主要是胃黏膜切除术(EMR、ESD)，切除病变组织送病理检查，可进一步明确诊断，并可以去除病变黏膜，以防止病情进一步恶化。
