著名胃肠病学家斯瓦茨有一句名言：“无酸无溃疡”，此语道出了消化性溃疡的重要致病因素，即是胃酸分泌过多，过多的胃酸分泌容易导致消化性溃疡的形成，所以抑制过多的胃酸是治疗溃疡病的主要手段。
质子泵抑制剂是抑制壁细胞分泌胃酸的最终环节，具有强大的抑酸作用，同时，由于其疗效确切、不良反应发生率较小，已成为临床医生的首选，此类药物如奥美拉唑、兰索拉唑，泮托拉唑、雷贝拉唑、艾司奥美拉唑、艾普拉唑等，其中埃索美拉唑镁、雷贝拉唑和艾普拉唑为新一代的质子泵抑制剂，具有起效更快，抑酸作用更强、更持久而且个体差异小等优点，临床使用较广。
H2受体拮抗剂仅对组胺引起的胃酸分泌起作用，抑酸作用不如质子泵抑制剂，临床已少用。
二、胃黏膜保护剂
胃黏膜保护剂可以加强胃黏膜防御功能，能对溃疡的愈合起到积极作用，是治疗消化性溃疡的基本药物之一。目前，胃黏膜保护剂众多，比如铝碳酸镁、硫糖铝、替瑞普酮、瑞巴派特、伊索拉定、胶体秘剂、枸橼酸铋钾、复方谷氨酰胺、吉法酯等，这些作用机制及服用时间各有不同，比如硫糖铝、胶体秘剂、枸橼酸铋钾可在酸性条件下形成保护膜，需要在饭前服用，而替瑞普酮、吉法酯可促进粘液的分泌，饭后服用生物利用度高，需要在餐后服用。在众多胃黏膜保护剂中，铝碳酸镁既有胃黏膜保护作用，又有中和胃酸、结合胆汁作用，有研究表明，铝碳酸镁与质子泵抑制剂联用治疗消化性溃疡特别合并胆汁反流者可取得良好的疗效。
三、中和胃酸药物
中和胃酸药物也称抗酸剂、制酸药，此类药物多为碱性物质，主要作用机理是中和胃酸，减少和缓解胃酸对胃的刺激。临床上应用的中和胃酸药物有铝碳酸镁、复方氢氧化铝、碳酸钙、碳酸氢钠等。
四、抗焦虑（抑郁）药
消化性溃疡是内科常见病、多发病，随着心理-社会-生物模式的发展，目前普遍认为消化性溃疡属于典型的心身疾病范畴之一。国内外的大量研究发现，心理因素可影响胃液分泌、粘膜血管充盈的程度和胃壁蠕动的变化。当心理因素与各种体质因素联合作用时，就有可能产生溃疡，消化性溃疡病人常伴有抑郁症状，在消化性溃疡的治疗上应予以小量抗焦虑或抗抑郁剂以调节情绪，可促进疾病的治愈率。抗抑郁药如舍曲林、氟西汀、氟伏沙明、帕罗西汀等，抗焦虑药物如地西泮、阿普唑仑、舒乐安定、氟哌噻吨美利曲辛、坦度螺酮等。
五、促胃（肠）动力药
促胃（肠）动力药如莫沙必利、伊托必利、多潘立酮、甲氧氯普胺也广泛用于消化性溃疡，促胃动力药可加强胃排空而使细菌不能在胃内久留，加强胃排空减轻食物对胃的刺激，同时可抑制十二指肠食物反流，减轻胆盐对胃的刺激，对于患有消化性溃疡伴胃动力不足尤为适合。
多潘立酮、甲氧氯普胺为促胃动力药，用于消化性溃疡伴胃排空障碍者，但不宜长期应用，通常，用于治疗急性恶心、呕吐的最长疗程为 1 周，治疗其他适应症的初始疗程最长为 4 周，如超过 4 周，需要对患者进行重新评价，并注意其可能的药品不良反应。莫沙必利、伊托必利为促胃肠动力药，对于消化性溃疡伴便秘者尤为适合，腹泻患者则需慎用。
六、对症治疗药物
消化性溃疡合并有消化不良者可选择助消化药如复方阿嗪米特、米曲菌胰酶、胰酶、多酶等。其中复方阿嗪米特既有促进胆汁分泌，还有助消化、消除胀气作用，可用于因胆汁分泌不足或消化酶缺乏而引起的症状。
消化性溃疡合并胃肠疼痛者可选择胃肠解痉剂如曲美布汀、匹维溴铵、屈他维林、颠茄片、奥替溴铵、山莨菪碱等对症治疗。
七、中成药
中成药选择需辨证论治，如:
肝气犯胃：复方田七胃痛胶嚢、乌贝散、健胃愈疡颗粒
脾胃气虚：胃苏颗粒、健胃愈疡片、胃乃安胶嚢、胃复春片
脾胃湿热：溃疡宁胶嚢、三九胃泰胶囊
脾胃虚寒：小建中颗粒、温胃舒胶囊
胃阴不足：阴虚胃痛颗粒、养胃舒胶囊
淤血阻络：摩罗丹、康复新液
寒热错杂：荆花胃康胶丸
