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若配植花灌木,则应在原防水保护层上再铺设经专家鉴定合格的能阻止植物根系生长时穿透防水层的防水材料,即耐根穿刺的阻隔根层,实行二道或二道以上的防水设防,放置阻隔根膜、保湿毯、滤水板、过滤膜,其上再铺装种植土。
空中花园则要铺设质量考究的抗根穿金属高分子复合防水材料,实行二道或二道以上阻根防水设防,再铺装保湿毯和滤水板,这种装置是以高密度聚乙烯等塑料片材经特殊工艺成型后制成的封闭凹凸的半锥状、柱状或半圆状壳体,这种膜、壳连续的材料具有立体空间特性且有一定支撑刚度,可以排水兼有蓄水功能,防止种植土流失,使水能够渗入蓄排水层的过滤膜,其上为种植土或轻型营养基质。
特别要保护和处置好屋面排水系统,做到排水畅通,基质不流失。无论哪种类型的屋顶绿化,屋顶植物种植面和建筑立面边缘不能直接靠近滤水板直接铺设在屋面，排水沟设置屋面四周,距女儿墙不少于30 cm。没有女儿墙的,距离立面边缘不得少于50 cm。
做好防护处理,设计和用材都要考究。无论哪种屋顶草坪,边沿砖、步道砖是要铺装的。边沿砖铺设：一是养护、观赏走动的需要，二是起到一定的稳固作用，三是可以形成图案,增加景观效果。这些都事关整个空中绿地的安全系数和景观效果。